Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN3O15551 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN3O15551 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN3O15551 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN3O15551 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN3O15551 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN3O15551 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms