Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Eftud2O08810 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eftud2O08810 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eftud2O08810 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms