Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GFRA2O00451 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA2O00451 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms