Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF28PB7ZC32 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF28PB7ZC32 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms