Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPDC1A2A3K4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPDC1A2A3K4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms