Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 DDR1-276ENST00000514534 566 ntTSL 39.42□□□□□ -0.97e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-204ENST00000422355 562 ntTSL 28.83□□□□□ -17e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.137e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.167e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.177e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-209ENST00000442614 869 ntTSL 27.08□□□□□ -1.287e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-207ENST00000434230 899 ntTSL 27.06□□□□□ -1.287e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.37e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.327e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-215ENST00000498064 451 ntTSL 26.57□□□□□ -1.367e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-214ENST00000492116 582 ntTSL 25.64□□□□□ -1.517e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-202ENST00000418819 849 ntTSL 35.28□□□□□ -1.567e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-213ENST00000488331 326 ntTSL 25.26□□□□□ -1.577e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-211ENST00000467755 370 ntTSL 1 (best)4.45□□□□□ -1.77e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MORF4L2-212ENST00000474653 573 ntTSL 24.33□□□□□ -1.727e-7■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.533e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 NDUFAF8-202ENST00000573090 741 ntTSL 320.18■□□□□ 0.823e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 NDUFAF8-206ENST00000577158 278 ntTSL 1 (best)18.33■□□□□ 0.523e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.083e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ZKSCAN8-204ENST00000606198 2057 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.151e-20■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.271e-20■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ZKSCAN8-203ENST00000536028 1052 ntTSL 25.95□□□□□ -1.461e-20■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.671e-20■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.097e-12■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 PAPOLA-207ENST00000554130 848 ntTSL 519.32■□□□□ 0.687e-12■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 PAPOLA-203ENST00000553357 585 ntTSL 515.9■□□□□ 0.147e-12■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 PAPOLA-221ENST00000556619 584 ntTSL 34.99□□□□□ -1.617e-12■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-218ENST00000544358 797 ntTSL 317.43■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-206ENST00000535970 736 ntTSL 317.25■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-216ENST00000542117 996 ntTSL 217.25■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-223ENST00000545396 1341 ntTSL 517.23■□□□□ 0.354e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-209ENST00000536615 627 ntTSL 217.04■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-208ENST00000536439 1426 ntTSL 316.72■□□□□ 0.274e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-221ENST00000545056 1568 ntTSL 515.1■□□□□ 0.014e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -04e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-219ENST00000544852 499 ntTSL 314.93□□□□□ -0.024e-6■□□□□ 9.2
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SF3B4Q15427 OGFOD2-220ENST00000545033 682 ntTSL 514.01□□□□□ -0.174e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-215ENST00000542037 1208 ntTSL 512.51□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-225ENST00000545976 374 ntTSL 311.63□□□□□ -0.554e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OGFOD2-217ENST00000542940 576 ntTSL 49.62□□□□□ -0.874e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 MPHOSPH9-208ENST00000539024 3414 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.222e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 OCIAD1-206ENST00000502972 1916 ntTSL 27.45□□□□□ -1.222e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM118A-203ENST00000424557 549 ntTSL 46.71□□□□□ -1.341e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM118A-206ENST00000452238 583 ntTSL 55.56□□□□□ -1.521e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 OCIAD1-214ENST00000508329 448 ntTSL 53.48□□□□□ -1.852e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 MAP3K4-212ENST00000542851 625 ntTSL 211.18□□□□□ -0.626e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 LRPPRC-205ENST00000447246 1209 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.39e-13■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ACSS2-223ENST00000494727 1030 ntTSL 28.93□□□□□ -0.986e-21■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 EIF4A2-226ENST00000497177 849 ntTSL 55.35□□□□□ -1.556e-11■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 EIF4A2-216ENST00000468362 1356 ntTSL 25.29□□□□□ -1.566e-11■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 CYP2W1-203ENST00000415893 890 ntTSL 316.47■□□□□ 0.232e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RTEL1-206ENST00000425905 664 ntTSL 212.17□□□□□ -0.462e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.214e-10■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 319.7■□□□□ 0.744e-10■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.354e-10■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.264e-10■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-10■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KLHL21-205ENST00000496707 824 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.054e-10■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.284e-10■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ARF1-205ENST00000473546 291 ntTSL 211.87□□□□□ -0.513e-19■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FLNA-214ENST00000474072 430 ntTSL 215.39■□□□□ 0.054e-17■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-206ENST00000526516 800 ntTSL 322.53■■□□□ 1.22e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RARRES2-204ENST00000478771 1907 ntTSL 219.63■□□□□ 0.732e-11■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.612e-11■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.582e-11■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 C7orf26-204ENST00000445375 675 ntTSL 517.98■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-11■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-209ENST00000528977 2385 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.222e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-210ENST00000529274 2427 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.182e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-212ENST00000530139 563 ntTSL 315.53■□□□□ 0.082e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-215ENST00000531746 1099 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.052e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RARRES2-203ENST00000467793 583 ntTSL 314.61□□□□□ -0.072e-11■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-214ENST00000531174 769 ntTSL 214.44□□□□□ -0.12e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-219ENST00000533340 851 ntTSL 514.07□□□□□ -0.162e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.332e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-218ENST00000532802 566 ntTSL 312.87□□□□□ -0.352e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-213ENST00000530995 942 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 SFI1-227ENST00000495107 735 ntTSL 312.38□□□□□ -0.432e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-221ENST00000533842 495 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-205ENST00000524445 622 ntTSL 59.97□□□□□ -0.812e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 NAALADL1-211ENST00000529685 604 ntTSL 39.58□□□□□ -0.882e-8■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ERBB3-211ENST00000549644 306 ntTSL 38.05□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.044e-9■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.334e-9■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-262ENST00000593342 271 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.76□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-250ENST00000486756 811 ntTSL 413.65□□□□□ -0.223e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-230ENST00000469960 772 ntTSL 212.97□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-265ENST00000601368 752 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-6■□□□□ 9.1
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