Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skp2Q9Z0Z3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms