Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD54BQ9Y620 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAD54BQ9Y620 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms