Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AGTPBP1Q9UPW5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGTPBP1Q9UPW5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms