Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psma4Q9R1P0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psma4Q9R1P0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms