Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC88CQ9P219 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms