Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3EQ9NVU0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR3EQ9NVU0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms