Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHPT1Q9NRX4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms