Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpr88Q9EPB7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpr88Q9EPB7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms