Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms