Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsfl1cQ9CZ44 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nsfl1cQ9CZ44 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nsfl1cQ9CZ44 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nsfl1cQ9CZ44 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nsfl1cQ9CZ44 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms