Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Mrps28Q9CY16 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms