Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Commd4Q9CQ02 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms