Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIOK1Q9BRS2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIOK1Q9BRS2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms