Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF560Q96MR9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms