Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP3Q96KP6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNIP3Q96KP6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms