Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHISA4Q96DD7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms