Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EAF2Q96CJ1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms