Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN4Q92575 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN4Q92575 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms