Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL22A1Q8NFW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COL22A1Q8NFW1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms