Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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