Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms