Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms