Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk13Q69ZA1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk13Q69ZA1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms