Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh2Q64221 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh2Q64221 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms