Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms