Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRCH2Q5VUJ6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms