Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NHSL1Q5SYE7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms