Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRB2Q5IJ48 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms