Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trat1Q3UU67 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trat1Q3UU67 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms