Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEN1Q17RS7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEN1Q17RS7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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