Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKIV2LQ15477 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms