Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
StumQ0VBF8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
StumQ0VBF8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms