Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF543Q08ER8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF543Q08ER8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms