Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAX2Q02962 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms