Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp10Q000W5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms