Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcls1P49710 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcls1P49710 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms