Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPAP49450 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPAP49450 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPAP49450 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPAP49450 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPAP49450 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPAP49450 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPAP49450 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPAP49450 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPAP49450 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms