Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP8P40818 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP8P40818 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP8P40818 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP8P40818 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP8P40818 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP8P40818 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP8P40818 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP8P40818 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP8P40818 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP8P40818 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP8P40818 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP8P40818 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP8P40818 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
USP8P40818 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP8P40818 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP8P40818 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms