Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZKSCAN1P17029 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZKSCAN1P17029 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZKSCAN1P17029 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZKSCAN1P17029 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZKSCAN1P17029 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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