Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms