Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLXNB1O43157 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLXNB1O43157 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms