Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEFVO15553 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEFVO15553 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEFVO15553 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEFVO15553 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEFVO15553 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEFVO15553 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEFVO15553 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEFVO15553 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEFVO15553 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEFVO15553 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEFVO15553 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms