Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx6-2D3Z4R4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-2D3Z4R4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms