Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cped1B2RX70 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cped1B2RX70 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms